西南交通大学实行“统一领导、集中管理”的财务管理模式，制订了《西南交通大学预算管理办法（修订）》（西交校〔2021〕24号）、《 西南交通大学预算绩效管理办法（试行）》（西交校〔2021〕21号）、《西南交通大学经济收入分配管理办法》（西交校〔2021〕1号）、《西南交通大学货币资金管理办法》（西交校计财〔2018〕2号）、《《西南交通大学国内差旅费管理办法》》（西交校计财[2021]6号））、《西南交通大学往来款管理办法》（西交校计财[2021]7号）等财务管理制度，明确支出审批管理，从源头上保证了经费的使用合规、合理。

西南交通大学执行政府会计制度，按《关于印发高等学校执行<政府会计制度——行政事业单位会计科目和报表>的补充规定和衔接规定的通知》设置会计科目，严格执行财经法规制度，确保核算内容和财务报告真实、准确和完整。

西南交通大学对科研专项经费的管理和核算，执行《国务院办公厅关于改革完善中央财政科研经费管理的若干意见》（国办发〔2021〕32号）、《国家重点研发计划资金管理办法》（财教〔2021〕178号）、《高等学校哲学社会科学繁荣计划专项资金管理办法》（财教〔2021〕285号）等相关规定，并相应制订了《西南交通大学科研经费管理办法》（西交校科〔2022〕3 号）等科研经费管理办法。

西南交通大学对科研专项经费的使用实际分项目单独核算，确保专款专用，明确内部管理权限和审批程序，完善内控机制建设，强化资金使用绩效评价，提高财务信息化水平，确保资金使用安全规范有效。